MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002662	CAG	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671983
2	NC_002662	T	7	7	441	447	0 %	100 %	0 %	0 %	15671983
3	NC_002662	TGTC	2	8	467	474	0 %	50 %	25 %	25 %	15671983
4	NC_002662	CTTG	2	8	495	502	0 %	50 %	25 %	25 %	15671983
5	NC_002662	A	6	6	514	519	100 %	0 %	0 %	0 %	15671983
6	NC_002662	ATT	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671983
7	NC_002662	A	6	6	529	534	100 %	0 %	0 %	0 %	15671983
8	NC_002662	CGG	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15671983
9	NC_002662	GAT	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671983
10	NC_002662	ATG	2	6	605	610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671983
11	NC_002662	AACTG	2	10	615	624	40 %	20 %	20 %	20 %	15671983
12	NC_002662	AATC	2	8	643	650	50 %	25 %	0 %	25 %	15671983
13	NC_002662	AGC	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671983
14	NC_002662	TTGCTG	2	12	779	790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15671983
15	NC_002662	TATT	2	8	818	825	25 %	75 %	0 %	0 %	15671983
16	NC_002662	TGG	2	6	828	833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15671983
17	NC_002662	ATGC	2	8	859	866	25 %	25 %	25 %	25 %	15671983
18	NC_002662	TGAC	2	8	884	891	25 %	25 %	25 %	25 %	15671983
19	NC_002662	TTC	2	6	918	923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671983
20	NC_002662	A	6	6	960	965	100 %	0 %	0 %	0 %	15671983
21	NC_002662	AAT	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671983
22	NC_002662	ACT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15671983
23	NC_002662	GATT	2	8	1299	1306	25 %	50 %	25 %	0 %	15671983
24	NC_002662	GGT	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15671983
25	NC_002662	A	6	6	1416	1421	100 %	0 %	0 %	0 %	15671983
26	NC_002662	A	7	7	1456	1462	100 %	0 %	0 %	0 %	15671983
27	NC_002662	ATT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671983
28	NC_002662	TTG	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671983
29	NC_002662	TGG	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15671983
30	NC_002662	CA	3	6	1627	1632	50 %	0 %	0 %	50 %	15671983
31	NC_002662	TAA	2	6	1899	1904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671984
32	NC_002662	TTGAAG	2	12	1988	1999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671984
33	NC_002662	TCAA	2	8	2038	2045	50 %	25 %	0 %	25 %	15671984
34	NC_002662	T	6	6	2049	2054	0 %	100 %	0 %	0 %	15671984
35	NC_002662	ATA	2	6	2063	2068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671984
36	NC_002662	TTA	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671984
37	NC_002662	GCT	2	6	2116	2121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671984
38	NC_002662	AGA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
39	NC_002662	ATCA	2	8	2499	2506	50 %	25 %	0 %	25 %	15671984
40	NC_002662	ATG	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671984
41	NC_002662	AAG	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
42	NC_002662	TTA	2	6	2598	2603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671984
43	NC_002662	TTGA	2	8	2611	2618	25 %	50 %	25 %	0 %	15671984
44	NC_002662	TGC	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671984
45	NC_002662	TTG	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671984
46	NC_002662	GTA	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671984
47	NC_002662	AGGT	2	8	2807	2814	25 %	25 %	50 %	0 %	15671984
48	NC_002662	GAA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
49	NC_002662	AAG	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
50	NC_002662	TGAT	2	8	2888	2895	25 %	50 %	25 %	0 %	15671984
51	NC_002662	GAA	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
52	NC_002662	GTAC	2	8	3010	3017	25 %	25 %	25 %	25 %	15671984
53	NC_002662	TA	3	6	3140	3145	50 %	50 %	0 %	0 %	15671985
54	NC_002662	ATT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
55	NC_002662	GAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
56	NC_002662	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
57	NC_002662	TTA	2	6	3219	3224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
58	NC_002662	CTT	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671985
59	NC_002662	GAAA	2	8	3258	3265	75 %	0 %	25 %	0 %	15671985
60	NC_002662	CAG	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671985
61	NC_002662	TTA	2	6	3339	3344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
62	NC_002662	ACA	2	6	3367	3372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15671985
63	NC_002662	CAG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671985
64	NC_002662	GAG	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15671985
65	NC_002662	AGA	2	6	3438	3443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
66	NC_002662	CTG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671985
67	NC_002662	T	6	6	3480	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	15671985
68	NC_002662	A	8	8	3573	3580	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
69	NC_002662	GAA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
70	NC_002662	ACT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15671985
71	NC_002662	GTC	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671985
72	NC_002662	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
73	NC_002662	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
74	NC_002662	AAAT	2	8	3986	3993	75 %	25 %	0 %	0 %	15671985
75	NC_002662	CTG	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671985
76	NC_002662	A	6	6	4076	4081	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
77	NC_002662	T	6	6	4095	4100	0 %	100 %	0 %	0 %	15671985
78	NC_002662	TAG	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
79	NC_002662	GCT	2	6	4132	4137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671985
80	NC_002662	GAAA	2	8	4152	4159	75 %	0 %	25 %	0 %	15671985
81	NC_002662	AAG	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
82	NC_002662	T	6	6	4231	4236	0 %	100 %	0 %	0 %	15671985
83	NC_002662	AAT	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671985
84	NC_002662	GAT	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
85	NC_002662	TCT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671985
86	NC_002662	TGA	2	6	4326	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
87	NC_002662	A	7	7	4386	4392	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
88	NC_002662	A	6	6	4508	4513	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
89	NC_002662	A	7	7	4518	4524	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
90	NC_002662	T	6	6	4685	4690	0 %	100 %	0 %	0 %	15671985
91	NC_002662	TGA	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
92	NC_002662	TTA	2	6	4729	4734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
93	NC_002662	TGT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671985
94	NC_002662	TTG	2	6	4808	4813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671985
95	NC_002662	TAA	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671985
96	NC_002662	AT	3	6	4830	4835	50 %	50 %	0 %	0 %	15671985
97	NC_002662	GAA	2	6	4903	4908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
98	NC_002662	ATCA	2	8	4918	4925	50 %	25 %	0 %	25 %	15671985
99	NC_002662	AAC	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15671985
100	NC_002662	TGA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
101	NC_002662	TGT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671985
102	NC_002662	A	7	7	4976	4982	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
103	NC_002662	CTTT	2	8	4996	5003	0 %	75 %	0 %	25 %	15671985
104	NC_002662	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
105	NC_002662	A	6	6	5111	5116	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
106	NC_002662	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671985
107	NC_002662	A	6	6	5123	5128	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
108	NC_002662	AAG	2	6	5132	5137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
109	NC_002662	TTG	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671985
110	NC_002662	GAA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
111	NC_002662	A	7	7	5231	5237	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
112	NC_002662	TGA	2	6	5238	5243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
113	NC_002662	T	6	6	5252	5257	0 %	100 %	0 %	0 %	15671985
114	NC_002662	A	6	6	5303	5308	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
115	NC_002662	TAT	2	6	5309	5314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
116	NC_002662	AAG	3	9	5540	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
117	NC_002662	TGA	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
118	NC_002662	ATG	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
119	NC_002662	ATG	2	6	5630	5635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
120	NC_002662	AGA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
121	NC_002662	AGAC	2	8	5677	5684	50 %	0 %	25 %	25 %	15671985
122	NC_002662	TGA	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
123	NC_002662	AGT	2	6	5743	5748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
124	NC_002662	GAA	2	6	5807	5812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
125	NC_002662	TCT	2	6	5833	5838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671985
126	NC_002662	ATT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
127	NC_002662	AAG	2	6	5945	5950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
128	NC_002662	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
129	NC_002662	TTTA	2	8	5981	5988	25 %	75 %	0 %	0 %	15671985
130	NC_002662	ATCA	2	8	6022	6029	50 %	25 %	0 %	25 %	15671985
131	NC_002662	ATG	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
132	NC_002662	A	7	7	6132	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	15671985
133	NC_002662	AAG	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
134	NC_002662	TGAA	2	8	6182	6189	50 %	25 %	25 %	0 %	15671985
135	NC_002662	ATGA	2	8	6346	6353	50 %	25 %	25 %	0 %	15671985
136	NC_002662	AATTGA	2	12	6559	6570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15671986
137	NC_002662	A	7	7	6595	6601	100 %	0 %	0 %	0 %	15671986
138	NC_002662	GCA	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671986
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407	NC_002662	AGC	2	6	19176	19181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671995
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